COLLAS Philippe

Fonction : Professeur / Directeur de Recherche

Tél : +47-22-85-10-66   Fax : +47-22-85-10-58

Mail : philippe.collas@medisin.uio.no

Site web : www.collaslab.com

Unité d'appartenance : Stem Cell Epigenetics Laboratory

Responsable d'unité : Philippe Collas

Code unité :

Institut : Institute of Basic Medical Sciences, University of Oslo

Ville : Oslo, Norvège  

Nom de l'équipe : Stem Cell Epigenetics Laboratory

Thématique de l'équipe (< 10 lignes) :

Quels sont les déterminants chromatiniens qui contrôlent le potentiel de différentiation des cellules souches somatiques ? Notre équipe cherche à comprendre les mécanismes epigénétiques de contrôle d’expression des gènes, ainsi que les procédés de régulation de l’organisation tridimensionnelle du génome dans les cellules souches mésenchymateuses humaines. Pour cela, nous étudions les mécanismes de déposition de marques epigénétiques et de variants d’histones aux gènes régulateurs de différentiation de cellules souches pré-adipeuses vers des types cellulaires spécifiques. Au niveau de l’architecture du noyau, nous regardons (1) comment les interactions génome-génome et les sites de contacts génomiques avec les lamines varient au cours de la différentiation ; (2) comment ces interactions sont affectées dans des maladies lipodystrophiques liées aux mutations de lamines ; et (3) comment certains complexes de transcription sont ancrés à la périphérie nucléaire.

Techniques utilisées :

Culture et différentiation de cellules souches humaines de tissue adipeux, vers des lignées adipogéniques, ostéogéniques et neuronales ; introduction de gènes/mutations dans cellules souches ; culture de lignées cellulaires; et imagerie analytique en « live » (FRAP, etc) ; IP  et pull-downs divers; analyse mutationelle ; immunoprecipitation de chromatine (ChIP) et d’ADN méthylé (MeDIP); analyses par séquençage haut-débit ; RNAseq ; analyses bioinformatiques. Nous mettons aussi en place les techniques 3C/4C/HiC.

Mots clés (thématiques et/ou techniques; <10) :

cellules souches adipeuses ; différentiation ; enveloppe nucléaire ; epigénétique ; lamines nucléaires ; organisation du noyau ; régulation des gènes