PANCALDI Vera

Fonction : CRCN INSERM, groupe leader, CRCT Chaire en bioinformatique en immuno-oncologie (Sep 2018-2023)

Tél : 05-82-74-16-93

Mail : vera.pancaldi@inserm.fr

 

Unité d'appartenance : INSERM Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse - CRCT

Responsable d'unité : Gilles FAVRE Code unité : ​UMR1037 Inserm/Université Toulouse III-Paul Sabatier, ERL5294 CNRS Institut : ​Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse - CRCT ​Section principale​ : INSERM CSS2

Ville : Toulouse Délégation régionale : Occitanie

 

Nom de l'équipe : ​Epigénomique et modélisation de réseaux appliquées à l’étude de l’hétérogénéité en immuno-oncologie

Responsable : Vera PANCALDI

Site web​https://www.crct-inserm.fr/21-v-pancaldi/

 

Thématique de l'équipe (< 10 lignes) : Nous sommes un laboratoire de bioinformatique, axé sur la production de méthodes pour étudier la structure du génome en relation avec le phénotype. Nous avons produit des outils qui exploitent la théorie des réseaux pour étudier la structure de la chromatine en tant que réseau. Notre objectif principal est d'étudier l'organisation de la chromatine 3D dans les cellules hématopoïétiques et son évolution dans la différenciation. Plus précisément, nous nous intéressons à l'importance de l'épigénome pour déterminer le comportement des cellules immunitaires lorsqu'elles rentrent dans les tumeurs. Nous intégrons différents types de données, y compris la transcriptomique, la méthylation de l'ADN et les modifications des histones pour révéler comment l'environnement des
cellules immunitaires, physico-chimique ou provoqué par la présence d'autres cellules, peut avoir un impact sur les phénotypes de ces cellules.

Techniques utilisées :

​Bioinformatique, théorie de réseaux, analyse de données HiC,
Transcriptomique, Deconvolution de types cellulaires, Modélisation Agent-Based,
Modèles Booléens, Imagerie, Deep learning

Mots clés (thématiques et/ou techniques; <10) :

Bioinformatique, Simulations, Modélisation logique, Réseaux, Hétérogénéité tumorale, Système immunitaire, Épigénomique, Transcriptomique, Architecture du génome.