Fonction : CRCN INSERM

Tél : 0426731360

Mail : kiran.padmanabhan@ens-lyon.fr

 

Unité d'appartenance : Institut de Génomique Fonctionnelle de Lyon (IGFL)

Responsable d'unité : Florence Ruggiero

Code unité : UMR5242     Institut : CNRS, ENS de Lyon , UBCL, INRAE     Section principale : 22

Ville : Lyon     Délégation régionale : DR7

 

Nom de l'équipe : Molecular and epigenetic regulation of biological clocks

Responsable : Kiran PADMANABHAN

Site web : http://igfl.ens-lyon.fr/equipes/k-padmanabhan-molecular-and-epigenetic-regulation-of-biological-clocks

 

Thématique de l'équipe (< 10 lignes) :

Notre équipe étudie les voies de signalisations moléculaires et épigénétiques qui contrôlent les oscillateurs biologiques, spécialement ceux qui aident à établir et faire fonctionner les horloges circadiennes chez les mammifères. Parmi les nombreux régulateurs épigénétiques, nous sommes particulièrement intéressés par des variantes des histones - facteurs clés qui contrôlent les sorties de transcription en régulant la structure de la chromatine. Le vieillissement physiologique aussi bien que pathologique coïncide avec une perte de la robustesse des oscillateurs circadiens et de l'état de la chromatine. En gardant cela à l'esprit, nous sommes intéressés par a) les principes moléculaires qui sous-tendent les états dynamiques de la chromatine sur 24h; b) l'influence de la structure chromatinienne sur l'horloge circadienne et sur l'assemblage et le désassemblage des complexes protéiques ;c) la modulation de ces phénomènes au cours du vieillissement normal et pathologique. Quels sont les impacts à court, moyen et à long terme de la désynchronisation circadienne sur le génome cellulaire et la chromatine et sont-ils réversibles?

Techniques utilisées : Mouse transgenics, ChIPSeq, RNAseq, MnaseSeq, Proteomics

Mots clés (thématiques et/ou techniques) : Circadian clocks, chromatin state, histone variants, ageing.