Fonction : Chef d’équipe / Chargé de recherche (CNRS)

Tél : 01 69 82 31 38     Fax : 01 69 82 31 60

Courriel : daan.noordermeer@i2bc.paris-saclay.fr

Site web : http://www.i2bc-saclay.fr/spip.php?article307

Unité d'appartenance :

Responsable d'unité : Thierry Meinnel

Code unité : UMR9198

Institut : Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC-CNRS, ancien Centre de Génétique Moléculaire)

Section principale : Biologie des Génomes

Ville : Gif-sur-Yvette     Délégation régionale : DR04

Nom de l'équipe : Heterochromatin dynamics / Dynamique de l’hétérochromatine

Thématique de l'équipe (< 10 lignes) :

3D genome organization is an essential component of transcriptional regulation. Similar to active genomic domains, heterochromatin regions adopt many types of 3D organization, ranging from megabase-scale Lamina Associated Domains to pinpointed 3D chromatin compartments. We study how 3D heterochromatin organization influences transcriptional outcome, how different levels of organization are related, and what is the effect of cellular heterogeneity. We address these questions in mouse cells (1) by systematically linking the different levels of 3D heterochromatin organization during the mouse life cycle (spanning embryogenesis, aging and carcinogenesis), (2) by functionally dissecting 3D heterochromatin structures by changing their molecular setup and (3) by developing novel technology to study 3D heterochromatin organization in individual cells.

Techniques utilisées :

Chromosome Conformation Capture based techniques : HiC and 4C-seq

ChiP-seq

RNA-seq

FISH (Fluorescent In-Situ Hybridization)

Mouse embryonic stem cell culture

Mouse embryonic stem cell transgenics

Mots clés (thématiques et/ou techniques; <10) :

Heterochromatin function

3D genome organization

Nuclear organization

Chromatin organization

Epigenetics

Stem cells

Chromosome Conformation Capture

HiC

4C-seq