LAVIGNE Marc

Fonction : Directeur de recherche, Institut Pasteur de Paris, en mission à l'Institut Cochin

Tél : 01 40 51 65 98 Fax : 01 40 51 65 70

Mail : marc.lavigne@pasteur.fr

 

Unité d'appartenance : Institut Cochin (INSERM U1016 - CNRS UMR8104 - Université de Paris)
Responsable d'unité : Pierre Olivier Couraud (Institut Cochin)
Code unité : UMR 8104     Institut : INSB     Section principale : 20, 21 et 27
Ville : PARIS     Délégation régionale : DR5

 

 

Nom de l'équipe : Groupe "Chromatine, topologie de l'ADN et réplication rétrovirale" dans l'équipe "Interactions hôte virus"

Responsable : Marc LAVIGNE

Site web : https://www.institutcochin.fr/la-recherche/3i/equipe-berlioz_torrent-emiliani

 

Thématique de l'équipe :

Notre équipe étudie le rôle de deux paramètres nucléaires dans la réplication des rétrovirus: l'organisation chromatinienne et la topologie de l'ADN.
 Par des approches de Chromosome Conformation Capture (HiC, MC-4C, HiC- CaptureC), nous étudions comment les génomes du VIH-1 et des cellules infectées interagissent entre eux et si ces interactions influent sur l'expression du génome viral. Nous étudions également la régulation de ces interactions par les ADN topoisomérases. Ce projet est réalisé en collaboration avec l'équipe de R. Koszul (I. Pasteur, Paris) également membre de ce GDR.
 Nous étudions comment la topologie de l'ADN et les ADN topoisomérases régulent la réplication du VIH-1. Nous avons récemment mis en évidence le rôle de l'ADN topoisomérase 1 (Top1) et de son interaction avec un quadruplex de guanines (G4) présent sur le promoteur viral dans la régulation transcriptionnelle de ce virus. Nous poursuivons l'étude de cette régulation et de son impact sur la latence virale. Ce projet est réalisé en collaboration avec les équipes de J-L Mergny (INSERM) et M-P Teulade-Fichou (I. Curie, Orsay)

Techniques utilisées :

- essais cellulaires d'infection par le VIH ou d'étude de l'étape de transcription et d'intégration
- HiC, CaptureC (collaboration R. Koszul)
- essais in vitro et in cellulo d'interaction ADN-proteine
- essai d'activité d'ADN topoisomérases
- étude de la structure et des partenaires de G4s (collaboration J-L Mergny et M-P Teulade-Fichou)

Mots clés (thématiques et/ou techniques :

Chromatine, Topologie de l'ADN, transcription, Quadruplex de Guanines, structure de l'ADN, organisation du noyau, réplication du VIH, latence virale.