Fonction : Directeur de Recherche CNRS
Tél : 01 44 32 36 61
Maill : david.holcman@ens.fr
Unité d'appartenance : IBENS
Responsable d'unité : Pierre Paoletti
Code unité : UMR8197 Institut : INSB Section principale : 4
Ville : Paris Délégation régionale : DR2 Paris B
Nom de l'équipe : Computational biology and data modeling
Responsable : David HOLCMAN
site web : http://www.biologie.ens.fr/bcsmcbs/
Thématique de l'équipe (< 10 lignes) :
Notre équipe s'intéresse à la problématique de l'organisation nucléaire par le biais de la modélisation physique, l’analyse de données et la simulations numérique. Nous avons développé divers modèles pour:
Nous nous intéressons aux processus de réparation de l'ADN après une cassure double brin, mais aussi a l’organisation des TADs dans les cellules cancéreuses du sein (coll. D. Noordann). Nous nous intéressons à la dynamique des remodelers avec Srinjan Basu, U. of Cambridge.
Ces travaux s’inscrivent dans une perspective plus globale de modélisation des propriétés de la cellule à l'échelle moléculaire en utilisant des techniques s’inspirant de la physique statistique, du calcul stochastique, et de simulations.
Modélisation mathématique et physique, simulations, calcul stochastique, analyse d'image, physique statistique.
Collaborations avec des expérimentalistes
A Taddei, K Dubrana, G Almouznie, T. Galli, N. Rouach, M. Segal, A. Prochaintz, A. Triller,
Mots clés (thématiques et/ou techniques; <10) :
Modélisation, simulations, cassure double brin, organisation nucléaire, télomère, polymère, chromatine, homologous recombination. Looping de l’ADN.
Thématique de l'équipe (< 10 lignes) :
Techniques utilisées :
Modélisation mathématique et physique, simulations, calcul stochastique, analyse
d'image, physique statistique.
Collaborations avec des expérimentalistes
K Dubrana, N. Rouach, D. Noordaan, E. Laue, S. Basu, D. Ron, E. Avezov
Mots clés (thématiques et/ou techniques; <10) :
Modélisation, simulations, cassure double brin, organisation nucléaire, polymère,
chromatine, homologous recombination. Looping de l’ADN. Cancer du sein
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