HOLCMAN David

Fonction : Directeur de Recherche CNRS

Tél : 01 44 32 36 61 

 Maill : holcman@biologie.ens.fr

Site web: http://www.biologie.ens.fr/bcsmcbs/


Unité d'appartenance : Institut de biologie

Responsable d'unité : A. Triller

Code unité : UMR8197      Institut : IBENS    Section principale : 4

Ville : Paris    Délégation régionale : DR2 Paris B

Nom de l'équipe : Theoretical modeling of cellular physiology

Thématique de l'équipe (< 10 lignes) :

Notre équipe s'intéresse à la problématique de l'organisation nucléaire par le biais de la modélisation physique, l’analyse mathématique et la simulations numérique. Nous avons développé un modèle de l'agrégation des télomères dans la levure, dans le but de comprendre le rôle conjoint de la localisation des chromosomes et des interactions moléculaires (complexe SIR2/3/4) dans la régulation génétique. Nous nous intéressons aux processus de réparation de l'ADN après une cassure double brin. Nous avons également analysé le « looping » de l’ADN, un processus lie a la régulation de la transcription.

Ces travaux s’inscrivent dans une perspective plus globale de modélisation des propriétés de la cellule à l'échelle moléculaire en utilisant des techniques s’inspirant de la physique statistique, du calcul stochastique, et de simulations.

Techniques utilisées :

Modélisation mathématique et physique, simulations, calcul stochastique, analyse d'image, physique statistique.

Collaborations avec des expérimentalistes

A Taddei, K Dubrana, G Almouznie, T. Galli, N. Rouach, M. Segal, A. Prochaintz, A. Triller,

Mots clés (thématiques et/ou techniques; <10) :

Modélisation, simulations, cassure double brin, organisation nucléaire, télomère, polymère, chromatine, homologous recombination. Looping de l’ADN.