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Unité d'appartenance : Régulation et Dynamique des Génomes

Responsable d'unité : Carine Giovannangeli

Code unité : UMR 7196          Institut : INC             Section principale : 16

Ville : Paris              Délégation régionale : Ile de France - Est

Nom de l'équipe : Répétitions centromériques et organisation du noyau

Thématique de l'équipe (< 10 lignes) :

Nous nous intéressons au rôle des séquences d’ADN répétées en tandem, très abondantes dans les régions centromériques des chromosomes eucaryotes. Notre hypothèse de travail est que ces séquences participent à l’organisation du génome dans le noyau et au contrôle de l’expression des gènes. Pour mieux comprendre leur rôle, nous caractérisons l’activité transcriptionnelle (nature et abondance des transcrits non-codants) de différentes répétitions dans plusieurs types cellulaires humains et murins, et dans différentes situations physiologiques (réponse au stress). Nous étudions également, par des approches d’imagerie, l’organisation nucléaire de ces séquences et les structures chromatiniennes associées. Nous abordons également l’existence de ces séquences sous un angle évolutif, en essayant de comprendre les mécanismes de leur évolution, mais aussi en exploitant leur diversité pour comprendre les mécanismes d’évolution des chromosomes.

Techniques utilisées :

biologie moléculaire et cellulaire (extraction et analyse d’acides nucléiques, culture et transfection de cellules, différentiation de cellules souches), bioinformatique (conception de sondes à partir d’alignements de séquences), imagerie (microscopie de fluorescence, immunomarquage, FISH, RNA-FISH, détection automatisée d’objets), modélisation statistique.

Mots clés (thématiques et/ou techniques; <10) :

ADN, séquences répétées, chromatine, ARN non-codants, épigénétique, transcription, centromère, organisation nucléaire, microscopie de fluorescence.