ARNEODO Alain

Nom de l'équipe : Mécanogénétique de la cellule

Fonction : Chercheur (DR1 CNRS - Emérite)

Tél : 05 40 00 62 04  Fax  :05 40 00 69 70

Mail : alain.arneodo@u-bordeaux.fr

Site web : https://www.loma.cnrs.fr/alain-arneodo/

Unité d'appartenance : Laboratoire Ondes et Matière d’Aquitaine

Responsable d'unité : Fabio Pistolesi


Code unité : UMR 5798

Institut : INP, INSIS

Sections principales : INP : 04, 05, 03, 08 / INSIS : 30, 28, 63

CNU : section 29

Ville : Talence

Délégation régionale : DR15 - Aquitaine

Nom de l'équipe : Mécanogénétique de la cellule

Thématique de l'équipe (< 10 lignes) :

Notre équipe de physiciens et de biophysiciens s’intéresse à la structure et à la dynamique de macromolécules biologiques (assemblages impliquant l’ADN, réseaux de filaments du cytosquelette, réseaux de mitochondries). En relation étroite avec les expérimentations biologiques, les activités de l'équipe participent à un projet de recherche centré sur l'analyse de la structuration du génome dans les cellules eucaryotes et à l’impact des propriétés mécaniques du microenvironnement des cellules sur la régulation épi-génétique des processus de transcription, de réplication et de réparation du génome au cours de la différentiation et dans les processus cancéreux. Nos domaines d'application concernent le programme de réplication de l'ADN chez les eucaryotes (timing de réplication, orientation des fourches de réplication) et l'écriture génomique du positionnement des nucléosomes. Nous étudions aussi l'influence du positionnement des nucléosomes sur l'évolution (profils de mutation, insertion des éléments transposables) des génomes de vertébrés.

Techniques utilisées – physique statistique des polymères et des systèmes désordonnés – traitement du signal et de l'image (transformation en ondelettes) – bioinformatique et

génomique – séquençage

Mots clés (thématiques et/ou techniques; <10) : mécanogénétique – mécanotransduction – physique du cancer – chromatine – positionnement du nucléosome – épigénétique – replication de l’ADN – fonctions nucléaires – différentiation – analyse et modélisation multi-échelle