Fonction: IR INRAE
Mail: katarzyna.adamczyk@inrae.fr
Unité d'appartenance : UR 1404 Mathématiques et Informatique Appliquées du Génome à l'Environnement (MaIAGE)
Responsable d'unité : Sophie Schbath
Code unité : UR 1404 Institut : INRAE
Ville : Jouy-en-Josas
Nom de l'équipe : Dynenvie: Modélisation dynamique et statistique pour les écosystèmes, l’épidémiologie et l’agronomie
Responsable: Elisabeta Vergu
Site web : https://maiage.inrae.fr/fr/dynenvie
Thématique de l'équipe (< 10 lignes) : Nous participons à différents projets impliquant traitement et analyse d'images (2D/3D + temps) et modélisation. En particulier, depuis 5 ans, nous collaborons avec des biologistes de l'INRA et du CEA sur l'analyse statistique de configurations spatiales d'éléments nucléaires (gènes, centromères etc...). Les outils mis en œuvre vont de la segmentation de compartiments nucléaires dans les images de microscopie à la caractérisation statistique de configurations spatiales et à leur comparaison. Depuis peu, nous abordons aussi la modélisation de la chromatine et l'analyse de données haut-débit (Hi-C en particulier).
Techniques utilisées : Traitement et analyse d'images 3D, statistique spatiale.
Mots clés (thématiques et/ou techniques; <10) : Statistique, modélisation stochastique, traitement d'image.
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