Fonction: IR INRAE

Mail: katarzyna.adamczyk@inrae.fr

 

Unité d'appartenance : UR 1404 Mathématiques et Informatique Appliquées du Génome à l'Environnement (MaIAGE)

Responsable d'unité : Sophie Schbath

Code unité : UR 1404    Institut : INRAE

Ville : Jouy-en-Josas

 

Nom de l'équipe : Dynenvie: Modélisation dynamique et statistique pour les écosystèmes, l’épidémiologie et l’agronomie

Responsable: Elisabeta Vergu

Site web : https://maiage.inrae.fr/fr/dynenvie

 

Thématique de l'équipe (< 10 lignes) : Nous participons à différents projets impliquant traitement et analyse d'images (2D/3D + temps) et modélisation. En particulier, depuis 5 ans, nous collaborons avec des biologistes de l'INRA et du CEA sur l'analyse statistique de configurations spatiales d'éléments nucléaires (gènes, centromères etc...). Les outils mis en œuvre vont de la segmentation de compartiments nucléaires dans les images de microscopie à la caractérisation statistique de configurations spatiales et à leur comparaison. Depuis peu, nous abordons aussi la modélisation de la chromatine et l'analyse de données haut-débit (Hi-C en particulier).

Techniques utilisées : Traitement et analyse d'images 3D, statistique spatiale.

Mots clés (thématiques et/ou techniques; <10) : Statistique, modélisation stochastique, traitement d'image.